Birželio mėnesio vidutinė oro temperatūra buvo 14,3…15,9 °C (daugelyje rajonų artima, vietomis šiaurės rytiniuose rajonuose 0,6–1,0 °C žemesnė, o Klaipėdoje 0,7 °C aukštesnė už 1981–2010 m. standartinę klimato normą (toliau – SKN)). Aukščiausia oro temperatūra daug kur pakilo iki 23…29 °C, Druskininkuose iki 30 °C. Birželio 3-osios rytą užregistruotos šalnos: žemiausia oro temperatūra vietomis nukrito iki -0,1…-1,4 °C, prie dirvos paviršiaus kai kur iki -7°C. Vietomis šalnos stebėtos ir birželio 28-osios rytą, Raseiniuose prie dirvos paviršiaus -1 °C.

Per birželio mėnesį daug kur šalies vakariniuose ir šiauriniuose rajonuose kritulių iškrito 46–83 mm (0,7–1,1 SKN), pietiniuose ir rytiniuose rajonuose 91–124 mm (1,2–1,5 SKN), vietomis pietrytiniuose rajonuose 131–148 mm (1,7–1,8 SKN), Lazdijuose 160 mm (2,1 SKN). Birželio 29 d. Vilniaus ir Lazdijų meteorologijos stočių, Molėtų automatinės agrometeorologijos stoties ir Trakų vandens matavimo stoties duomenimis buvo stebėtas lokalus stichinis meteorologinis reiškinys (labai smarkus lietus), pietrytinėje Lietuvos dalyje stebėtas stichinis meteorologinis reiškinys – labai smarki audra. Birželio mėnesį vietomis iškrito kruša.

Didžiausias vėjo greitis birželį daug kur siekė 15–19 m/s, Biržuose 20 m/s, Lazdijuose 21 m/s, Prienuose, Kybartuose ir Rokiškyje 22 m/s.

Saulė šį mėnesį spindėjo 200–280 val. (daug kur 23–61 val. trumpiau už SKN).

Birželio mėnesį vandens lygis upėse svyravo nežymiai. Kražantėje ties Pluskiais minimalus vandens lygis buvo 3 cm žemesnis už iki šiol stebėtą birželio mėnesį. Po gausių kritulių birželio 29–30 d. didžiausi kilimai per parą stebėti Verknėje ties Verbyliškėmis (34 cm), Neryje ties Vilniumi ir Jonava (23 cm). Vidutinis mėnesio vandens lygis upėse buvo nuo 35 cm žemesnis už birželio mėnesio vidutinį daugiametį (Nevėžyje ties Babtais) ir iki 13 cm aukštesnis už vidutinį daugiametį (Akmenoje-Danėje ties Kretinga).

Šilčiausias vanduo daugelyje upių stebėtas birželio 20 d. (nuo 16,2 °C Kražantėje ties Pluskiais iki 21,4 °C Jūros upėje ties Taurage). Paskutinę mėnesio dieną vandens temperatūra buvo nuo 14,2 °C (Bartuvoje ties Skuodu) iki 20,7 °C (Nemune ties Druskininkais).

Vidutinis birželio mėnesio vandens lygis Tauragno ežere buvo 4 cm, Totoriškių ežere – 9 cm žemesnis už šio mėnesio vidutinį daugiametį. Paskutinę mėnesio dieną vandens temperatūra ežeruose siekė 18,3 °C (Tauragno ežere), 19,4 °C (Totoriškių ežere).