Rugsėjo mėnesio vidutinė oro temperatūra Lietuvoje buvo 12,9 °C (teigiama 0,7° anomalija). Vėsiausia buvo rytiniame pakraštyje 11,6 °C (teigiama 0,1° anomalija), šilčiausia – pietvakariuose (13,0–13,6 °C) ir pajūryje 14,2–14,6 °C (teigiama 1,0° anomalija), Nidoje 15,1 °C (teigiama 0,9° anomalija) (1 pav.). Aukščiausia oro temperatūra pakilo iki 26–29 °C. Žemiausia oro temperatūra nukrito iki -5…0. °C, pajūryje ir pamaryje 1–2 °C ir Nidoje 6 °C.

Rugsėjo mėnesį vidutinis kritulių Lietuvoje buvo 66 mm (artimas SKN). Didžiojoje šalies dalyje kritulių kiekis buvo 30–60 mm (0,5–1 SKN). Didesnis kritulių kiekis registruotas šiauriniame ir rytiniame pakraščiuose bei Žemaitijoje: 60–140 mm (0,9–1,6 SKN), Kretingoje 161 mm (1,7 SKN) (2 pav).

Vidutinė Saulės spindėjo trukmė buvo artima SKN, 179 val. Ilgiausiai Saulė švietė Pietų Lietuvoje ir šiaurinėje dalyje, t.y. Biržų apylinkėse (191–200 val., 1,2 SKN), trumpiausiai – pajūryje, Šiaulių ir Utenos rajonuose , trumpiau nei 170 val. (0,8–1,1 SKN) (3 pav.).

Didžiausias vėjo greitis siekė 15–19 m/s, vietomis 20–23 m/s.

Rugsėjo 13 d. daugelyje šalies rajonų vidutinei paros oro temperatūrai nukritus žemiau 15 °C, oficialiai baigėsi meteorologinė vasara – tai įvyko vidutiniškai 3 savaitėmis vėliau, nei įprasta. Šiais metais meteorologinė vasara, daugelyje šalies rajonų prasidėjusi gegužės 17 d., visoje šalyje tęsėsi vidutiniškai 120 d. – net 6 savaitėmis ilgiau lyginant su SKN. Rugsėjo 23–27 d. rytais daugelyje šalies rajonų buvo fiksuotos šalnos, vietomis iki -4 °C.

Aukščiausios purenamo ruožo temperatūros buvo fiksuotos pirmą mėnesio dešimtadienį ir mėnesio eigoje palaipsniui krito. Vidutinė mėnesio purenamo ruožo temperatūra 10 cm gylyje daugelyje šalies rajonų svyravo apie 13–16 °C, aukščiausia daug kur siekė 23–27 °C, Klaipėdoje apie 29 °C, žemiausia, paskutinėmis mėnesio dienomis, krito iki 4–6 °C. Aukščiausia dirvožemio temperatūra 20 cm gylyje kilo iki 20–26°, žemiausia krito iki 7–9 °C.

Vertinant agrometeorologines sąlygas pagal hidroterminio koeficiento (toliau – HTK) reikšmes, rugsėjo mėnesio pradžioje užsitęsęs sausas periodas Palangos ir Mažeikių teritorijose buvo pasiekęs pavojingo meteorologinio reiškinio rodiklius (sausringas laikotarpis aktyviosios augalų vegetacijos metu pavojingu meteorologiniu reiškiniu laikomas tada, kai HTK < 0,5 išsilaiko 15–30 dienų). Didžiojoje šalies dalyje drėgnumas buvo optimalus, tik rytiniame šalies pakraštyje pirmąjį mėnesio dešimtadienį fiksuota perteklinė drėgmė. Vis tik kritulių kiekis nebuvo pakankamas, todėl antrasis mėnesio dešimtadienis buvo daug sausesnis: nepaisant to, jog sausra, kaip pavojingas meteorologinis reiškinys, pasitraukė iš Lietuvos teritorijos, daug kur šalyje fiksuotos labai sausos arba sausringos sąlygos, kurios tęsėsi iki pat dešimtadienio pabaigos. Trečiojo rugsėjo mėnesio dešimtadienio pradžioje didžiojoje šalies dalyje vyravo optimalus drėgnumas arba tik nedidelis drėgmės trūkumas, sausringos sąlygos vyravo tik Akmenės, Šakių ir Vilkaviškio savivaldybėse, tačiau po poros dienų situacija vėl suprastėjo – daug kur šalies šiaurėje ir kai kur pietuose tapo sausringa arba įsivyravo nepakankamas drėgmės trūkumas, centrinėje šalies dalyje daugiausia vyravo sausos arba labai sausos sąlygos. Gausiau palijus paskutinę mėnesio dieną situacija vėl pagerėjo ir daug kur įsivyravo optimalus drėgnumas. Vis tik atkreiptinas dėmesys į vakarinį šalies pakraštį, kur paskutinėmis mėnesio dienomis laikėsi optimalios sąlygos arba perteklinis drėgnumas, o paskutinę rugsėjo mėnesio dieną Kretingos, Plungės ir Telšių rajonuose jis tapo itin didelis.

Vandens lygis upėse svyravo nežymiai. 3 VMS vandens lygis buvo 2–11 cm žemesnis už iki šiol stebėtą rugsėjį. Vidutinis mėnesio vandens lygis daugelyje upių buvo 12–77 cm žemesnis už rugsėjo mėnesio vidutinį daugiametį. Gamtosauginiai vandens debitai išmatuoti 11 VMS.

Žemiausia vandens temperatūra upėse buvo 4,7–10,8 °C (rugsėjo 24–27 d.). Per mėnesį vanduo atvėso 8–12 °C.

Vidutinis rugsėjo mėnesio vandens lygis Tauragno ežere buvo 15 cm žemesnis už šio mėnesio vidutinį daugiametį. Vidutinė mėnesio vandens temperatūra buvo 1,9 °C aukštesnė nei daugiametis vidurkis. Paskutinę mėnesio dieną vandens temperatūra siekė 13 °C.